De vlag van Warmenhuizen stamt uit 1973. Op 14 april in dat jaar keurde de toenmalige gemeenteraad van de gemeente Warmenhuizen (later opgegaan in de gemeente Harenkarspel, dat op 1 januari 2013 weer opging in de gemeente Schagen) het ontwerp goed. Tegenwoordig mag de vlag worden gebruikt om de identiteit van het dorp Warmenhuizen te benadrukken. De vlag is gemaakt door Faber, een vlaggenfabriek die garant staat voor kwaliteitsvlaggen. Afmeting van de vlag: 100 x 150 cm.